孵化用种蛋要保存在洁净的环境中，不能沾水、粪和其他污秽物，更不能放在过分干燥、有挥发性气体和高温、阳光直射之下。鸽蛋可保存在5℃冷藏室内，却绝对不能放在冷冻室内。种蛋保存期越短越好。冷藏鸽蛋取出后，直接放入巢中孵蛋亲鸽的胸脯底下直接孵化，不必担心鸽会遇凉受惊，也不必放在室外等待复温后再放入，否则会使冷藏种蛋的表面出现水分凝结成冷凝水，反而破坏鸽蛋外面的自然保护层。头蛋取出后放入假蛋。蛋在放置期间不要过多翻动，始终要求轻拿轻放，防止晃动或震动，宜大头向上，这样有利于胚珠系带松弛和蛋黄位置的固定。
鸽蛋取出，用细记号水笔（不宜用铅笔）标上记号，标注巢号或配对鸽品系的代码、出生日期、蛋次即可。及时做好书面记录，便于以后查阅。种蛋不得放在阳光直射下或被雨水淋湿、粪便污染处，更不能放置在音响、电视机、微波炉、电磁器具等有强磁场干扰的环境下。
取出初蛋的初衷，是为了能等次蛋产下后，同时进入孵化状态，使这对雏鸽能同时出壳，同步健康发育。而有的将种蛋暂时保存，移待另一窝保姆鸽生蛋时再进行孵化。对于后者，最好将种蛋放置在密封盒子里，外面套个扎口塑料袋，置于冰箱5℃冷藏室内。等需要孵化时，连扎口塑料袋一起取出，不要急于打开，而任其自然慢慢复温，或索性直接取出，放置在亲鸽的胸脯下，使所孵蛋很快进入孵化状态。
冰箱冷藏室保存的种蛋一般不宜超过5~7天，最长不超过14天，不过也有保存达21天、甚至32天仍能孵出健康雏鸽的记录。
有的鸽友认为，取出初蛋这是一种人为过于干预现象，因鸽会自然进行调节，它们会自己进行凉蛋。初蛋经过凉蛋，会自然中止或延缓胚胎的发育，而等待次蛋落巢它就会正式进入孵化状态。即使是发生一大一小，对于往后的健康、发育和赛绩也不会产生任何影响。因而在正常育雏孵化季节，对于有孵化经验之鸽，鸽友们无须过多干预，任其自然孵化育雏。
但在南方地区，气候相对较温暖，尤其气温接近25℃左右时，此时的自然凉蛋已是形同虚设，可将初蛋取出低温保存或冷藏，待次蛋即将产出前放入，以求进行同步孵化，出壳和出雏。
头蛋放入复温预热的时间，要按当时的气温进行调控，灵活掌握。如气温在21~38℃时，头蛋应在隔天的中午放入，同时取出假蛋即可，这样待次蛋产出时会同步进入孵化、破壳、出雏进程。有的鸽友主张在下午放入，这样往往会使次蛋先出，不过次蛋先出片刻也决无大碍。如气温大于38℃时，冷藏保存下的头蛋，应在隔天的早晨8~9时放入为好。至于在寒冷的冬季育雏时，取出的头蛋最好是能在第2天晚上7~8时放入。
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