先说结论：冥王哈迪斯跟双子神被杀了，但并没有被彻底消灭。
- 《圣斗士星矢》中的神话体系
根据集英社出版的圣斗士公式书《圣斗士星矢大全》里，关于《大圣战史》的记录，SS故事中的神跟希腊神话里的神只是名字撞车，其他设定基本上不挨着。
首先，宇宙大爆炸的时候，有两种物质充斥着宇宙空间，一种叫宇宙碎片，一种叫“众神的意志”(Big Will) 。两种碎片的碰撞，形成了满天星辰。
而“众神的意志”是诞生生命的重要元素，在“众神的意志”高度集中的地球，形成了宇宙中第一批生命，并且诞生了人类这种特殊生命体。人类不但继承了宇宙碎片的能量，能够觉醒体内的小宇宙，而且还有一部分特殊人类，觉醒了“众神的意志”。
地球上第一批觉醒“众神的意志”的三个人，分别是统治天空的宙斯、统治海洋的波塞冬、统治冥界的哈迪斯。
由此可知，SS框架下的神，本身就是人类，只不过是继承了大爆炸后另一部分宇宙碎片的特殊人类罢了。
- 诸神之战与各方势力的结局
波塞冬、哈迪斯、宙斯三个主神在各自的地盘发展壮大，形成了自己的神族体系，并且召集了一批拥有小宇宙力量的人类给自己当打手，随时准备火并。
某年某月某一天，宙斯将大地的统治权交给了那个性格又葛又好斗的闺女雅典娜，宙斯自己则消失在天空中。
作为宙斯的兄弟，波塞冬跟哈迪斯看到雅典娜一个女流之辈，内心燃起了欺软怕硬的纯爷们斗志，表示咱们干不过你老爹，难道还干不过你个寡妇失业的！
于是三叔波塞冬率先发难，命令一群穿着鳞衣的海斗士进攻大地，把雅典娜军打了个满地找牙溃不成军。危急关头雅典娜找到穆大陆炼金术士，为自己手下的小弟打造了三个等级得圣衣（黄金、白银、青铜），结果分分钟扭转战局。不但击溃了海皇军，强拆了波塞冬的陆地要塞亚特兰蒂斯，还把波塞冬的灵魂封印到夜壶里，扔到极北之地派人看管起来。
之后雅典娜率领着圣斗士们先后跟巨人族、战神阿瑞斯进行了火并，雅典娜凭着胜利女神的加持，一次又一次有惊无险的赢下了战斗，直到自己的大伯哈迪斯出手，雅典娜军才真正感到了亚历山大。
哈迪斯为了对抗雅典娜跟他的圣斗士，花重金买来了冥界最昂贵的黑宝石，打造了一批外形华丽而且坚固耐操的冥衣。而且最不要脸的一点，哈迪斯还派遣了自己手下两个二级神参加战斗，于是乎双子神带着108魔星怒刷圣域副本。
由于敌营有超纲的神级战力，所以雅典娜军一度被杀得裤衩满天飞，就连最强的黄金圣斗士都被杀得只剩了3人，结果雅典娜表示你们不要脸那就别怪老娘没羞没臊，兄弟们摆阵。
于是最后的三名黄金圣斗士使用了禁忌招式“雅典娜的惊叹”，一个超级大波直接平推了冥王军，不但把剩下的冥斗士全部干死，还把双子神的灵魂轰出了寄宿体，被雅典娜放饼干盒子里封印了起来。
但这一轮圣战后，雅典娜军只剩了两个黄金圣斗士幸存，一个是天秤座童虎，另一个是穆大陆后裔史昂。雅典娜把童虎派去五老峰坐桩，让史昂坐上教皇宝座重新招人，等待着下一届圣战的到来。
- 三大主神的不同降世形态
雅典娜作为历届圣战的唯一赢家，全宇宙唯一的正义之神，她降世的形态就是转生。
由于雅典娜属皮皮虾，喜欢跟自己手下捉迷藏，所以每次转生都会随机选择寄宿体。而圣斗士们为了找到雅典娜并且接回圣域，经常都要等到她成年以后，觉醒了神格才能感知到那股巨大的小宇宙。
比如上一届圣战的萨莎，非常顽皮的跟哈迪斯人柱力亚伦成了兄妹，而且一直到亚伦被哈迪斯附身，觉醒了冥王意志，萨莎才整明白自己是雅典娜。而萨莎的神格刚觉醒没多久，就遇到城户纱织为了救星矢，从未来穿越到ND圣战中，搅乱了时空秩序，导致萨莎的雅典娜意志被冲没了，整个人陷入植物神状态。
而SS这一届圣战中，雅典娜一出生就被精通念动力的史昂给找到了，然后接回圣域保护起来。可惜又赶上撒加之乱，雅典娜还没把老板位置坐热乎，就被艾俄洛斯救走，跑去城户集团当大小姐姐为了。
所以对于雅典娜来说，通过灵魂转生的就是本体，城户纱织是雅典娜，萨莎也是雅典娜。
波塞冬则不一样，因为他是圣战的第一个挑头者，而且是最早吃瘪并且被封印灵魂的苦主，所以波塞冬根本无法像雅典娜一样转生。他要继续搞事情，只有两种方法，第一种就是等着雅典娜的封印变弱，而雅典娜这一世还没完全觉醒的时候，自己先破壶而出，然后找到寄生体并复活。第二种就是被人提前撕开封印，然后以不完全形态觉醒，而这时候进入寄生体会呈现高度不稳定的状态，也就是一会儿是海皇一会儿是人类，而且附带着被唤醒的海皇军也实力忽高忽低，跟海贼王里的大将一样。
而作为波塞冬寄生体的人类，都是波塞冬灵魂被封印时，使用的人类肉体的后代，这一支大多是从事跟海洋相关的生意，比如SS时代船王的儿子朱利安索罗。
所以波塞冬不需要进入轮回，也不必等着转生体觉醒神格，只要灵魂从壶里出来，直接就会进入寄生体朱利安。而朱利安被附体后直接就拥有海皇的记忆跟神力，所以他也可以算是波塞冬本体，只不过人类灵魂跟神的灵魂经常切换，信号一会儿有一会儿没有。
哈迪斯则是三人中最矫情的一个，由于哈迪斯自己掌控死亡，所以他的本体真身一直放在极乐净土沉睡。从神话时代被天马座给弄伤了之后，哈迪斯几万年都没舍得激活过。
而几万年来的历届圣战，哈迪斯都是找最纯洁的人类肉体附身，以人柱力的形式降世，然后跟雅典娜死磕。ND中的亚伦，SS中的阿瞬，都是哈迪斯指定的人柱力。
但这种借用肉体的方式会有一个风险，那就是人柱力的灵魂如果过于强大，那就可能反噬哈迪斯的灵魂，直接把他的意志取代，然后使用他的神力去为所欲为，比如亚伦就演了这么一出反客为主的大戏，把潘多拉跟108魔星玩得团团转。
而阿瞬则在雅典娜鲜血的刺激下，直接用自己的小宇宙把哈迪斯灵魂从肉体里挤兑了出去，害得哈迪斯灵魂只能逃回极乐净土，并且真身被青铜五小强给强行激活，最后还被雅典娜用黄金杖来了一个透心凉。
- 哈迪斯真身死亡后仍然可以转生
作为十二主神之一的冥王哈迪斯，即使真身被雅典娜杀死，他的灵魂也不会因此湮灭。按照《大圣战史》的设定，所有主神本来都是人类，只不过觉醒诸神的意志后，拥有了掌管某种规则的能力而已。所以神也同样会死亡，死了之后灵魂继续转生，等着觉醒神格之后该干嘛干嘛就行了。
而哈迪斯掌控着死亡，所以他可以让自己的真身不死，灵魂也不用进入轮回。但在真身被杀死以后，他自己建立的冥界秩序也随之崩溃，哈迪斯的灵魂就只能跟雅典娜一样，进入随机转生程序。而作为哈迪斯狗腿的双子神，也是同样的待遇。
至于下一世哈迪斯还要不要跟雅典娜死磕，那就看剧情的需要了，反正就哈迪斯这种24K纯反派属性，让他洗白都找不到更坏的神代替。
照我的看法这三个神在极乐净土是真身，被消灭就真的死了，除非剧情需要，留下灵魂，在某个契机之下夺取某个人身体重生。
神的行为很好解释，神跟人类不在同一个位面，神是没法直接去人类位面的，就像我们玩网游一样，神可以登录游戏账号，进入游戏，拥有游戏中所有神装和技能，但是上限不能不能超过游戏角色最大等级，有一次游戏里的12名圣域玩家合力艰难的杀死这个神，但是神又建立小号，重新改出MAX等级和神装登录游戏和圣域玩家厮杀，还建立了一个冥界公会，召集108个公会成员，到处追杀圣域玩家，一时间圣域玩家死伤惨重。
终于有一天，五个游戏中的圣域玩家在一名叫小娜的黑客玩家指引下，沿着网线找到了你的家（极乐净土），冲进你家里把你们三个所谓的‘神’打成重伤，送进ICU[我想静静]，然后游戏里再也没有神了[捂脸]
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